GenBank mohou být předkládány pouze původní sekvence. Přímá podání jsou do GenBank prováděna pomocí BankIt, což je webová forma, nebo samostatného programu pro podání, Sequin. Po obdržení sekvenčního podání pracovníci GenBank prověří originalitu dat a přidělí sekvenci přístupové číslo a provedou kontroly zajištění kvality. Podání jsou pak uvolněna do veřejné databáze, kde jsou záznamy k dispozici pro Entrez nebo ke stažení na FTP. Hromadná podání dat Expressed Sequence Tag (EST), Sequence-tagged site (STS), Genome Survey Sequence (GSS) a High-Throughput Genome Sequence (HTGS) jsou nejčastěji předkládána rozsáhlými sekvenčními centry. Skupina přímých podání GenBank také zpracovává kompletní mikrobiální sekvence genomu.
Walter Goad ze skupiny pro teoretickou biologii a biofyziku v Národní laboratoři Los Alamos a další založili v roce 1979 Los Alamos Sequence Database, která vyvrcholila v roce 1982 založením veřejné GenBank. Financování zajišťovaly Národní instituty zdraví, Národní vědecká nadace, Ministerstvo energetiky a Ministerstvo obrany. LANL spolupracoval na GenBank s firmou Bolt, Beránek a Newman a do konce roku 1983 v ní bylo uloženo více než 2000 sekvencí.
V polovině 80. let řídila bioinformatická společnost Intelligenetics na Stanfordově univerzitě projekt GenBank ve spolupráci s LANL. Projekt GenBank jako jeden z prvních projektů bioinformatiky na internetu založil zpravodajské skupiny BIOSCI/Bionet pro podporu komunikace s otevřeným přístupem mezi biovědci. V letech 1989 až 1992 přešel projekt GenBank do nově vytvořeného Národního centra pro biotechnologické informace.
Genbank and EMBL: NucleotideSequences 1986/1987 Volumes I to VII.
Růst v GenBank základních párů, 1982 až 2007, na semi-log stupnici
V poznámkách GenBank k vydání 162.0 (říjen 2007) se uvádí, že „od roku 1982 do současnosti se počet základen v GenBank zdvojnásobil přibližně každých 18 měsíců“.
Databáze GenBank zahrnuje další datové soubory, které jsou sestaveny mechanicky ze sběru dat hlavní posloupnosti, a proto jsou z tohoto počtu vyloučeny.