Na základě přehledu literatury o 23 studiích Goldman & Padayachi zjistili, že prevalence pohlavního zneužívání dětí se pohybuje mezi 7-62% u dívek a 4-30% u chlapců. Metaanalytická studie Rinda, Tromovitche a Bausermana zjistila, že hlášená prevalence pohlavního zneužívání u mužů se pohybuje od 3% do 37% a u žen od 8% do 71% s průměrnou mírou 17%, respektive 28%. Berl Kutchinsky tvrdí, že většina prevalencí je přehnaná a tvrdí, že skutečná prevalence pohlavního zneužívání dětí může být až 1-2%. Studie incestu ve Finsku mezi otci a dcerami zjistila prevalenci 0,2% u biologických otců a 0,5% u nevlastních otců. Jiní tvrdí, že prevalence je mnohem vyšší a že mnoho případů zneužívání dětí není nikdy hlášeno. Jedna studie zjistila, že profesionálové neohlásili přibližně 40% případů pohlavního zneužívání dětí, se kterými se setkali Studie společnosti Lawson & Chaffin ukázala, že mnoho dětí, které byly sexuálně zneužívány, bylo „identifikováno pouze fyzickou stížností, která byla později diagnostikována jako pohlavní nemoc…Pouze 43% dětí, u kterých byla diagnostikována verneralová nemoc, učinilo během úvodního rozhovoru verbální odhalení pohlavního zneužívání.“
V amerických školách je podle amerického ministerstva školství „téměř 9,6% studentů terčem sexuálních pochybení pedagogů někdy během jejich školní kariéry“. Ve studiích sexuálního zneužívání studentů muži a ženami pedagogy byli muži studenti uváděni jako terče v rozmezí od 23% do 44%. V prostředí amerických škol se sexuální pochybení osob stejného pohlaví (žen a mužů) vůči studentům pedagogy „pohybuje v rozmezí od 18-28% nebo hlášených případů, v závislosti na studii“.
Má se za to, že k významnému podhodnocení sexuálního zneužívání chlapců ženami i muži dochází v důsledku pohlavní steoreotypizace, sociálního popírání, minimalizace mužské viktimizace a relativního nedostatku výzkumu sexuálního zneužívání chlapců. Sexuální viktimizace chlapců jejich matkami nebo jinými ženskými příbuznými je zkoumána nebo hlášena zvláště zřídka. Sexuální zneužívání dívek jejich matkami a dalšími příbuznými a/nebo nepříbuznými dospělými ženami začíná být zkoumáno a hlášeno navzdory vysoce tabuizované povaze pohlavního zneužívání dětí ženami a ženami. Ve studiích, kde jsou studenti dotazováni na sexuální delikty, uvádějí vyšší počet sexuálních delikventek, než je zjištěno v hlášeních pro dospělé. Toto nedostatečné vykazování bylo připsáno kulturnímu popírání sexuálního zneužívání dětí páchaného ženami, protože „muži byli socializováni tak, aby věřili, že by měli být polichoceni nebo oceňováni sexuálním zájmem ze strany ženy“ a protože sexuální zneužívání mužů ženami je často považováno za „žádoucí“ a/nebo prospěšné soudci, odborníky v masmédiích a dalšími úřady.