V klinické psychologii a psychiatrii jsou funkční poruchy poruchami, o nichž se předpokládá, že jsou způsobeny psychologickými faktory a nejsou organické povahy, tj. není u nich zjištěna fyziologická nebo anatomická příčina. Pojem „funkční“ může mít dva významy:
To, zda je daný zdravotní stav označován jako funkční porucha, závisí částečně na stavu poznání. Některé poruchy, včetně epilepsie, schizofrenie a migrény, byly kdysi považovány za funkční poruchy, ale dnes se již takto obecně neklasifikují.