Evoluční medicína nebo darwinistická medicína je obor poznání, který integruje medicínu s evoluční biologií, přesněji s adaptačním programem.
Teorie evoluce naznačuje, že všechny živé bytosti jsou výsledkem procesu známého jako evoluce přirozeným výběrem. Tento proces nastává vždy, když geneticky ovlivněná variace mezi populací ovlivňuje reprodukční úspěch. Například genetická mutace, která způsobuje větší zranitelnost vůči chorobám, se sníží ve frekvenci ve srovnání s její alternativní alelou, která způsobuje větší odolnost vůči chorobám.
Předpokládá se, že evoluce přirozeným výběrem vytvořila funkční design pozorovaný u živých bytostí, známý jako adaptace, a proto nemoc a onemocnění lze vysvětlit pomocí analýzy nákladů v. přínosů fyziologické funkce. Pochopení evolučního designu pomáhá lékařským výzkumníkům vysvětlit jevy jako: infekce, zranění, intoxikace, genetické nemoci, stárnutí, alergie, problémy během porodu, rakovina a duševní poruchy.
Známým příkladem aplikace evoluční medicíny je studium evolučních závodů ve zbrojení mezi obranyschopností těla a patogeny. Dalšími příklady jsou lidské populace, které mají určité náchylnosti k nemocem, které vznikly jako umožnění jejich přežití. Patří mezi ně srpkovitá anémie chránící proti malárii a hemochromatóza chránící proti dýmějovému moru.
Mezi výzkumníky v této oblasti, kteří získali nedávné uznání, jsou: Paul W. Ewald, Randolph M. Nesse a George C.