V genetickém kódu je stop kodon (nebo terminační kodon) nukleotidový triplet v RNA, který signalizuje ukončení translace. Základem proteinů jsou polypeptidy, což jsou jedinečné sekvence aminokyselin. Většina kodonů v messengerové RNA odpovídá přidání aminokyseliny do rostoucího polypeptidového řetězce, který se nakonec může stát bílkovinou. Stop kodony signalizují ukončení tohoto procesu vazbou uvolňovacích faktorů, které způsobí disociaci ribozomálních podjednotek a uvolnění řetězce aminokyselin.
Ve standardním genetickém kódu je několik stop kodonů:
Kodon UGA byl nedávno identifikován jako kodon kódující selenocystein (Sec). Tato aminokyselina se nachází ve 25 selenoproteinech, kde se nachází v aktivním místě proteinu. Transkripce tohoto kodonu je umožněna blízkostí elementu SECIS (SElenoCysteine Incorporation Sequence).
Kodon UAG se může překládat na pyrrolyzin podobným způsobem, jakým je kódován selenocystein.
Nonsense mutace jsou změny v sekvenci DNA, které zavádějí předčasný stop kodon, což způsobuje abnormální zkrácení výsledného proteinu. To často způsobuje ztrátu funkce proteinu, protože se již nevytvářejí kritické části řetězce aminokyselin. Kvůli této terminologii se stop kodony označují také jako nesmyslné kodony.
Názvosloví jantaru, okru a opálu
Stop kodony měly v minulosti mnoho různých názvů, protože každý z nich odpovídal odlišné třídě mutantů, které se chovaly podobně. Tyto mutanty byly poprvé izolovány v bakteriofázích (T4 a lambda), virech, které infikují bakterie Escherichia coli. Mutace ve virových genech oslabovaly jejich infekční schopnost a někdy vytvářely viry, které byly schopny infikovat a růst pouze v určitých odrůdách E. coli.