Tandemové opakování

Tandemové repetice jsou typem repetitivní DNA a vyskytují se v DNA, když se opakuje vzorec dvou nebo více nukleotidů a tyto repetice spolu přímo sousedí.

ve kterém se třikrát opakuje posloupnost A-T-T-C-G.

Pokud se opakuje 10 až 60 nukleotidů, nazývá se minisatelit. Ty s menším počtem se nazývají mikrosatelity nebo krátké tandemové repetice.

Pokud se opakují přesně dva nukleotidy, nazývá se to „dinukleotidová repetice“ (například: ACACACACAC…). Mikrosatelitní nestabilita u dědičného nepolypózního karcinomu tlustého střeva nejčastěji postihuje právě takovéto oblasti.

Pokud se opakují tři nukleotidy, nazývá se to „trinukleotidová repetice“ (například: CAGCAGCAGCAG…) a abnormality v těchto oblastech mohou vést k poruchám trinukleotidových repetic.

Pokud číslo není známé, je proměnlivé nebo irelevantní, nazývá se někdy tandemová repetice s proměnlivým číslem (VNTR). MeSH řadí tandemové repetice s proměnlivým počtem pod minisatelity.

Tandemové opakování popisuje vzorec, který pomáhá určit dědičné znaky jedince.

Tandemové repetice mohou být velmi užitečné při určování původu. Krátké tandemové repetice se používají pro některé genealogické testy DNA.

DNA se zkoumá z mikrosatelitů v chromozomální DNA.
Minisatelit je jiný způsob, jak říci speciální oblasti lokusů.
Na minisatelitních oblastech se provádí polymerázová řetězová reakce (neboli PCR).
PCR musí být provedena na každém testovaném organismu.
Amplifikovaný materiál se poté podrobí elektroforéze.
Kontrolou procenta shodných pásů se určí rodičovství.

V oblasti informatiky lze tandemové repetice v řetězcích (např. v sekvencích DNA) efektivně detekovat pomocí sufixových stromů nebo sufixových polí.

Studie z roku 2004 spojují neobvyklou genetickou plasticitu psů s mutacemi v tandemových repeticích.

Doporučujeme:  Dospívající těhotenství