Cytoplazma je část buňky, která je uzavřena v plazmatické membráně. U eukaryotických buněk obsahuje cytoplazma organely, jako jsou mitochondrie, které jsou naplněny tekutinou a od zbytku cytoplazmy odděleny buněčnými membránami. V cytoplazmě probíhá většina buněčných činností, například mnoho metabolických pochodů a procesů, jako je buněčné dělení.
Část cytoplazmy, která se nenachází v organelách, se nazývá cytosol. Cytosol je složitá směs vláken cytoskeletu, rozpuštěných molekul a vody, která vyplňuje velkou část objemu buňky. Cytosol je gel se sítí vláken rozptýlených ve vodě. Kvůli této síti pórů a vysoké koncentraci rozpuštěných makromolekul, jako jsou bílkoviny, dochází k efektu zvanému makromolekulární stěsnání a cytosol nepůsobí jako ideální roztok. Tento efekt stěsnání mění vzájemnou interakci složek cytosolu.
Cytoplazma má tři hlavní části: cytosol, organely a inkluze.
Proteiny v různých buněčných kompartmentech a strukturách označené zeleným fluorescenčním proteinem.
Cytosol je část buňky, která není uzavřena v membránových organelách. Cytosol je průsvitná tekutina, v níž jsou zavěšeny ostatní cytoplazmatické elementy. Cytosol tvoří asi 70 % objemu buňky a skládá se z vody, solí a organických molekul. Cytoplazma obsahuje také proteinová vlákna, která tvoří cytoskelet, a rozpustné proteiny a velké struktury, jako jsou ribozomy, proteazomy a záhadné trezorové komplexy. Vnitřní, zrnitá a tekutější část cytoplazmy se označuje jako endoplazma.
Organely jsou membránou vázané oddíly v buňce, které mají specifické funkce. Mezi hlavní organely zavěšené v cytosolu patří mitochondrie, endoplazmatické retikulum, Golgiho aparát, lysozomy a v rostlinných buňkách chloroplasty.
Inkluze jsou malé částice nerozpustných látek suspendované v cytosolu. V různých typech buněk existuje obrovské množství inkluzí, od krystalů oxalátu vápenatého nebo oxidu křemičitého u rostlin až po granule materiálů pro ukládání energie, jako jsou škroby, glykogen nebo polyhydroxybutyrát. Zvláště rozšířeným příkladem jsou lipidové kapénky, což jsou kulovité kapénky složené z lipidů a proteinů, které se používají u prokaryot i eukaryot jako způsob ukládání lipidů, jako jsou mastné kyseliny a steroly. Lipidové kapénky tvoří většinu objemu adipocytů, což jsou specializované buňky pro ukládání lipidů, ale vyskytují se i v řadě dalších typů buněk.