Koronální řezy lidského mozku zobrazující bazální ganglie, globus pallidus: externí segment (GPe), subthalamické jádro (STN), globus pallidus: interní segment (GPi) a substantia nigra (SN).
Subhalamické jádro je malé jádro bazálních ganglií ve tvaru čočky. Jak název napovídá, subthalmické jádro (STN) se nachází ventrálně od thalamu, těsně nadřazené vnitřní kapsli. Subhalamické jádro využívá excitační neurotransmiter glutamát a vytváří těsnou regulační smyčku s vnějším segmentem globus pallidus (GPe) zvaným síť STN-GPe.
Vzájemně propojené oblasti subthalamického jádra a vnějšího segmentu projektu globus pallidus s podobnými oblastmi vnitřního segmentu globus pallidus a substantia nigra (pars reticulata). Má se za to, že tato síť hraje klíčovou roli při vytváření vzorců aktivity pozorovaných u Parkinsonovy nemoci.
Bazální ganglie jsou převážně GABAergní (obsahují neurotransmiter GABA). Ačkoli dopaminergní (obsahující dopamin) buňky substantia nigra jsou neuromodulační, subthalamické jádro je jediným excitačním jádrem bazálních ganglií. Proto se nazývá „hnací silou“ bazálních ganglií.
Jednostranná destrukce subthalamického jádra produkuje hemiballismus.
Pineal body · Habenula · Habenulární trigone · Habenulární commissure
Pretektální oblast · Habenulární jádra · Subcommissurální orgán
Stria medullaris thalamus · Thalamic reticular nucleus · Taenia thalami
spárované: AN · Ventrální (VA/VL, VP/VPM/VPL) · Laterální (LD, LP, Pulvinar) · Metathalamus (MG, LG)
midline: MD · Intralaminar (Centromedian) · Midline nuclear group · Interthalamic adhesion
Mammillothalamic fasciculus · Pallidothalamic tracts (Ansa lenticularis, Lenticular fasciculus, Thalamic fasciculus) · PCML (Medial lemniscus, Trigeminal lemniscus) · Spinothalamic tract · Lateral lemniscus · Dentatothalamic tract · Akustické záření · Optické záření · Subthalamic fasciculus · Anterior trigeminothalamic tract
Medián eminence/Tuber cinereum · Mammillary body · Infundibulum
Přední (parasympatické/tepelné ztráty) · Zadní (sympatické/tepelné konzervace)
zadní hypofýza: magnocelulární/paraventrikulární/supraoptická (oxytocin/vazopresin)
jiné: parvocelulární/Arcuate (dopamin/GHRH) · Preoptické (GnRH) · Suprachiasmatické (melatonin)
Laterální (hlad) · Ventromedial (sytost) · Dorsomedial (vztek)
afferent (SN → Medial forebrain bundle) · efferent (Mammillothalamic fasciculus → AN, Stria terminalis → Amygdala, Dorsal longitudinal fasciculus → SC)
Zadní je diencefalon, ale přední je žláznatá
Subthalamic nucleus · Zona incerta
Hypothalamic sulcus · Tela chorioidea třetí komory