V genetické epidemiologii je celogenomová asociační studie (GWA study, nebo GWAS) – známá také jako celogenomová asociační studie (WGA study) – zkoumáním genetických variací napříč daným genomem, navržená tak, aby identifikovala genetické asociace s pozorovatelnými znaky. V lidských studiích to může zahrnovat znaky jako krevní tlak nebo hmotnost nebo to, proč někteří lidé onemocní nebo onemocní.
Dokončení projektu Lidský genom v roce 2003 umožnilo nalézt genetické příspěvky k běžným onemocněním a analyzovat celogenomové vzorky na genetické variace, které přispívají k jejich vzniku.
Tyto studie vyžadují dvě skupiny účastníků: lidi s touto nemocí a podobné lidi bez ní. Po získání vzorků od každého účastníka je sada markerů, jako jsou SNP, naskenována do počítačů. Počítače zkoumají genom každého účastníka kvůli markerům genetické variace.
Pokud jsou genetické variace častější u lidí s onemocněním, říká se, že variace jsou „spojeny“ s onemocněním. Přidružené genetické variace jsou pak považovány za ukazatele do oblasti lidského genomu, kde se nachází problém způsobující onemocnění. Vzhledem k tomu, že celý genom je analyzován na genetické asociace konkrétního onemocnění, tato technika umožňuje zkoumat genetiku onemocnění způsobem, který není založen na hypotézách.
Lidé se liší genetickou výbavou pouze o 0,1%, ale tato malá část genomu obsahuje klíčové rozdíly, které mohou určit náchylnost člověka k nemocem. Studie GWA umožňují výzkumníkům identifikovat faktory v mnoha oblastech, včetně výzkumu astmatu, rakoviny, cukrovky, srdečních onemocnění a duševních onemocnění a klinické péče.
S tím, jak lidé migrují a uzavírají sňatky v průběhu generací, je stále obtížnější omezit studie na biologické údaje; například lidé s tuberkulózou, kteří se stěhují do Colorada, mohou vést k závěrům, že lidé v Coloradu jsou biologicky náchylní k tuberkulóze, pokud není správně zohledněna korekce na populační stratifikaci.
V roce 2005 bylo prostřednictvím malého GWAS zjištěno, že věkem podmíněná makulární degenerace je spojena s variací genu pro faktor H komplementu, který produkuje protein, který reguluje zánět.
První velký GWAS publikoval v časopise Nature v únoru 2007 Robert Sladek a kol. ve studii pátrající po variantách diabetu II. typu.
Práce probíhala především v centru Genome Quebec na McGillově univerzitě, i když zahrnovala spolupráci s vědci z Imperial College London a dalších výzkumných institucí.
Skupina testovala 392’935 jednonukleotidových polymorfismů a identifikovala několik asociací, mimo jiné v genech nazývaných TCF7L2 a SLC30A8.
V roce 2007 Wellcome Trust Case Control Consortium provedlo celogenomové asociační studie nemocí koronárních srdečních chorob, diabetu 1. typu, diabetu 2. typu, revmatoidní artritidy, Crohnovy choroby, bipolární poruchy a hypertenze. Tato studie byla úspěšná při odhalování mnoha nových genů nemocí, které jsou základem těchto chorob.
Někteří kritici studií GWA je považují za extrémně nákladnou „tovární vědu“. Alternativy jako analýza vazeb mají oproti GWA výhody, jako je robustnost vůči alelické heterogenitě.
Robert Elston je prominentním zastáncem spojování, i když připouští, že asociace může být občas užitečná.
Podle Pearsonova a Manoliova hodnocení techniky „může být GWA přístup také problematický, protože masivní počet provedených statistických testů představuje bezprecedentní potenciál pro falešně pozitivní výsledky“.