Otevřený čtecí rámec neboli ORF je část genomu organismu, která obsahuje sekvenci bází, které by potenciálně mohly kódovat protein. Začátek a konec ORF nejsou ekvivalentní koncům mRNA, ale jsou obvykle obsaženy v mRNA. V genu jsou ORF umístěny mezi sekvencí počátečního kódu (iniciační kodon) a sekvencí stop kódu (terminační kodon). ORF se obvykle vyskytují při prosévání kousky DNA při snaze najít gen. Protože existují variace v sekvenci počátečního kódu organismů s pozměněným genetickým kódem, ORF bude identifikován odlišně. Typický vyhledávač ORF bude používat algoritmy založené na existujících genetických kódech (včetně těch pozměněných) a všech možných čtecích rámcích.
Ve skutečnosti je existence ORF, zejména dlouhého, obvykle dobrým ukazatelem přítomnosti genu v okolní sekvenci. V tomto případě je ORF součástí sekvence, která bude přeložena ribozomy, bude dlouhá, a pokud je DNA eukaryotická, ORF může pokračovat přes mezery zvané introny. Krátké ORF se však mohou objevit i náhodně mimo geny. ORF mimo geny obvykle nejsou příliš dlouhé a končí po několika kodonech.
Jakmile je gen sekvenován, je důležité určit správný otevřený čtecí rámec (ORF). Teoreticky lze sekvenci DNA přečíst v šesti čtecích rámcích u organismů s dvouvláknovou DNA; tři v dopředném a tři v opačném směru. Nejdelší sekvence bez stop kodonu obvykle určuje otevřený čtecí rámec. To je případ prokaryot. Eukaryotická mRNA je typicky monocistronická, a proto obsahuje pouze jeden ORF. Při práci s eukaryotickou pre-mRNA vzniká problém: dlouhé části DNA v ORF nejsou přeloženy (introny). Když je cílem najít eukaryotické otevřené čtecí rámce, je nutné se podívat na spliced messenger RNA mRNA.
Například pokud máte 5′-UCUAAAGGUGAC-3′ má 2 ze 3 možných čtecích rámečků. Toto je jedna ze 2 možných sekvencí mRNA přepisu a vidíme, že může být čtena 3 různými způsoby:
Jak vidíte, 3. možnost má stop kodon, tedy pouze 2 ze 3 čtecích rámců jsou otevřené (aka nemají stop kodony).