Kombinace pohlavních chromozomů (chromozomy Y a chromozomy X) přispívá k pohlaví zvířete člověka.
Většina sexuálních organismů má dvě pohlaví. V mnoha případech je určení pohlaví genetické: samci a samice mají různé alely nebo dokonce různé geny, které určují jejich pohlavní morfologii. U zvířat je to často doprovázeno chromozomálními rozdíly.
Systém určování pohlaví XX/XY je jedním z nejznámějších systémů určování pohlaví a vyskytuje se u lidí a většiny dalších savců, i když alespoň jeden ptakopysk monotreme, ptakopysk, představuje zvláštní schéma určování pohlaví, které se v některých ohledech podobá schématu pohlavních chromozomů ptáků ZW, a také postrádá gen SRY. Několik Arvicolinae (hraboši a lumíci) a někteří další hlodavci jsou také známí svými neobvyklými systémy určování pohlaví.
V systému určování pohlaví XY mají samice dva pohlavní chromozomy stejného druhu (XX), zatímco samci mají dva odlišné pohlavní chromozomy (XY). Některé druhy (včetně lidí) mají gen SRY na chromozomu Y, který určuje samčí samčí samčí samčí samčí samčí samčí samčí samčí samčí samčí samčí samčí samčí samčí, jiné (například octomilka) používají k určování samičí samčí samčí samčí samčí samčí přítomnost dvou chromozomů X. Pohlavní chromozomy XY se od sebe liší tvarem a velikostí na rozdíl od autosomů a označují se alosomy.
V této variantě systému XY mají ženy dvě kopie pohlavního chromozomu (XX), ale muži pouze jednu (X0). 0 označuje absenci druhého pohlavního chromozomu. Tento systém je pozorován u řady hmyzu, včetně kobylek a cvrčků řádu Orthoptera a u švábů (řád Blattodea).
Hlístice C. elegans je samec s jedním pohlavním chromozomem (X0); s párem chromozomů (XX) je hermafrodit.
hermafroditi mají oba pohlavní chromozomy.
Systém určování pohlaví ZW se vyskytuje u ptáků a některých druhů hmyzu a dalších organismů. Systém určování pohlaví ZW je v porovnání se systémem XY obrácený: samice mají dva různé druhy chromozomů (ZW) a samci dva stejné druhy chromozomů (ZZ).
Haplodiploidy se vyskytují u hmyzu patřícího do čeledi Hymenoptera, například u mravenců a včel. Z neoplodněných vajíček se vyvinou haploidní jedinci, kterými jsou samci. Diploidní jedinci jsou obecně samice, ale mohou to být sterilní samci. Pokud se tedy včelí královna spáří s jedním trubcem, její dcery sdílejí ¾ svých genů mezi sebou, ne ½ jako v systémech XY a ZW. To je považováno za významné pro rozvoj eusociality, protože to zvyšuje význam výběru příbuzných.
To je běžné také u vos, které jsou parazitické, a u samců zelené rybky.