Vlákna očního nervu vznikají z jádra ve středním mozku, které leží v šedé látce dna mozkového akvaduktu a na krátkou vzdálenost zasahuje před akvadukt až do dna třetí komory. Z tohoto jádra vlákna procházejí vpřed tegmentem, červeným jádrem a mediální částí substantia nigra, přičemž vytvářejí řadu křivek s laterální konvexitou a vystupují z očního boláku na mediální straně mozkového pedikulu.
Jádro očního nervu se neskládá ze souvislého sloupce buněk, ale je rozděleno do několika menších jader, která jsou uspořádána do dvou skupin, přední a zadní. Těch z zadní skupiny je šest co do počtu, z nichž pět je symetrických na obou stranách střední linie, zatímco šestá je centrálně umístěna a je společná pro nervy obou stran. Přední skupina se skládá ze dvou jader, antero-mediální a antero-laterální .
Jádro očního nervu, posuzované z fyziologického hlediska, může být rozděleno do několika menších skupin buněk, přičemž každá skupina ovládá určitý sval.
Nedaleké jádro, Edinger-Westphalovo jádro, je zodpovědné za autonomní funkce očního nervu, včetně zúžení zornic a přizpůsobení čočky.
cerebrální peduncle: midbrain tegmentum (periaqueductal gray, ventral tegmentum, nucleus raphe dorsalis), pretectum, substantia nigra, red nucleus, pedunculopontine nucleus, medial longitudinal fasciculus, medial lemniscus, rubrospinal tract, lateral lemniscus
tectum: corpora quadrigemina, inferior colliculi, superior colliculi
mozkový akvadukt: oční jádro, trochleární jádro, Edinger-Westphal jádro