Isaac Newton od Godfreyho Knellera, 1689
Newton se narodil 4. ledna 1643 ve Woolsthorpe, Lincolnshire. Jeho otec, prosperující zemědělec, který se také jmenoval Izák, zemřel několik měsíců před jeho narozením, a když se jeho matka znovu vdala, Newton zůstal v péči svých prarodičů. Jeho matka se vrátila o několik let později a po dokončení školy v Granthamu nastoupil v roce 1661 na Cambridgeskou univerzitu, kde studoval matematiku, fyziku a astronomii. V roce 1665 ho mor donutil opustit Cambridge a přestěhovat se zpět do svého rodinného domu. Během této doby vytvořil základní pojmy pro velkou část své budoucí práce, později nazval tyto roky „prvopočátkem mého věku pro vynálezy“. Po návratu na univerzitu byl v roce 1667 zvolen Fellow of Trinity College a v roce 1669 Lucasian Professor of Mathematics. O dva roky později byl zvolen Fellow of the Royal Society a v roce 1703 se stal prezidentem, což byla pozice, kterou zastával až do své smrti. V roce 1687, po letech intenzivní práce a výměna s předními intelektuály své éry, vydal jeho Principia Mathematica Philosophiae Naturalis, považován za jeden z nejvlivnějších vědeckých knih všech dob. V roce 1696 se přestěhoval do Londýna jako Warden na Královské mincovny, se stal Master of the Mint v roce 1699. Jeho druhé velké dílo, Opticks, se objevily v roce 1704, a následující rok byl povýšen na rytíře v Cambridge. Zemřel v roce 1727 ve věku 84, poté, co se stal mezinárodní celebritou a pre-vynikající vědec své doby. Nicméně, jak se stalo známo pouze ve 30. letech, Newton věnoval mnohem více času na alchymické a teologické výzkum než na fyziku nebo matematiku.
Zdá se, že Newton ve svém dětství vykazoval agresivní a nespolečenské chování. V seznamu hříchů sestaveném v roce 1662 přiznává, že bil svou sestru a další, a také vyhrožoval svým rodičům, že jim podpálí dům. Později v životě se jeho agresivita musela zmírnit a není uváděno, že by se jako dospělý choval nějak zvlášť nepříjemně. Naopak, Humphrey Newton, jeho amanuensis po dobu pěti let, napsal krátce po Newtonově smrti, že prožíval to druhé jako „zklidnění & dokonce Temper … bez hněvu, nedůtklivosti nebo vášně“, a William Stukeley, jeden z jeho prvních životopisců, si vzpomněl, že ho často viděl smát se, a řekl, že má „přirozenou příjemnost temperamentu“. Nicméně byl také považován za samotáře a až do pozdního věku si udržoval malý okruh známých, obvykle pobýval ve společnosti několika blízkých přátel, jako byl švýcarský matematik Fatio de Duillier nebo jeho nevlastní neteř Catherine Barton. Jeho potíže se sociálními vztahy přetrvávaly po celý jeho život a nezdá se, že by byl někdy zapleten do romantického románku s mužem nebo ženou. Podle Humphreyho Newtona se plně věnoval studiu, chodil pozdě spát a málo jedl, často byl pohroužen do myšlenek a nedbal na věci kolem sebe. Tyto a další osobnostní rysy vedly psychologa Simona Barona-Cohena ke spekulacím, že Newton mohl mít Aspergerův syndrom, což je přisuzování, které lze stále nalézt v mnoha populárně-vědeckých knihách.
Často známým rysem Newtonovy osobnosti byl jeho pozoruhodný strach z kritiky, který vyústil v váhání s publikováním nových děl. Ačkoli Newton vyvinul svou verzi kalkulu dříve než Gottfried Wilhelm Leibniz, publikoval svou práci teprve v roce 1704, dvacet let po Leibnizově publikaci. To vedlo k hořké polemice mezi Leibnizem a Newtonem o prioritě metody, která pokračovala až do Leibnizovy smrti v roce 1714. Když kolega z Královské společnosti Robert Hooke tvrdil, že Newton se od něj naučil zákonu inverzní kvadratury gravitace, Newton se cítil hluboce uražen a vyhrožoval, že přestane pracovat na třetí knize Principia. Právě díky diplomatickým schopnostem Edmonda Halleyho Newton pokračoval v práci, ale nevydal svou novou knihu Opticks, dokud Hooke nezemřel. William Whiston, Newtonův nástupce na Lucasovo křeslo v Cambridge, popsal svého předchůdce jako „nejvíce ustrašeného, opatrného a podezřelého temperamentu“. Výzkumníci jako Sula Wolff, Anthony Storr nebo Hershman a Lieb předložil argument, že by mohl trpět maniodeprese, a David F. Horrobin vidí schizotypální tendence v Newtonově chování.
Newton utrpěl během svého života nejméně dvě psychická zhroucení. K prvnímu došlo v roce 1678, po intenzivní hádce s Robertem Hookem a rok před smrtí jeho matky. Druhé, v roce 1693, bylo zřejmě ještě závažnější a Newton trpěl nespavostí, ztrátou chuti k jídlu a paranoidními bludy, které vedly k tomu, že posílal podivné a útočné dopisy přátelům a kolegům. V dopise Samuelu Pepysovi uvedl, že se cítil „extrémně znepokojen“ z „embroilmentu“, ve kterém se nacházel, a uvedl, že v předchozích dvanácti měsících nejedl ani dobře nespal. Také naříkal, že nemá svou „dřívější důslednost mysli“. Po uzdravení o několik měsíců později se omluvil svým přátelům a vrátil se do práce jako předtím. Nicméně incident mohl mít trvalé následky na Newtonovu psychiku, jak tvrdili Hershman a Lieb. Někteří autoři připisují rozpad roku 1693 otravě kovy v důsledku alchymistických experimentů, protože ve vlasech z Newtonovy mrtvoly bylo po exhumaci nalezeno vysoké množství rtuti. Nicméně teorie o otravě byla zpochybňována jinými, částečně proto, že vykazoval jen málo běžných příznaků.
Newton vyrůstal bez svého otce, který zemřel několik měsíců před Izákovým narozením. Co bylo pravděpodobně horší, jeho matka Hanna Ayscoughová zanechala svého syna v péči jeho babičky, aby si mohla vzít Barnabase Smithe, muže, ke kterému Izák cítil hlubokou nenávist. Do Woolsthorpe se vrátila až v roce 1653, kdy bylo Izákovi deset let. V té době už mladý muž objevil jeho intelektuální talent, ale Hanna chtěla, aby se stal farmářem jako jeho otec a vzala ho ze školy. Naštěstí se ukázalo, že jako farmář selhal a brzy se vrátil do Granthamu, aby pokračoval ve studiu. Opuštění matkou mohlo mít na mladého Izáka traumatizující vliv a někteří, jako Milo Keynes, tvrdili, že jeho intelektuální ambice byly částečně způsobeny jeho potřebou získat zpět sebevědomí. Pro Franka E. Manuela byla Newtonova matka zastíněnou postavou v jeho životě a jakýsi oidipovský komplex vysvětluje mnoho jeho charakterových rysů. Manuel si například myslí, že Newtonovy teologické ambice a protitrinitářské přesvědčení se vyvinuly, protože toužil po lásce k Bohu místo po lásce své matky a viděl Krista jako soupeře. Ve svých alchymistických spisech se často zmiňoval o sobě samém als Ieova sanctus unus (Jehova, Svatý), anagram jeho latinského jména.
Newton se nikdy neoženil a neexistují věrohodné záznamy o tom, že by byl někdy zapleten do romantického vztahu. To vedlo komentátory k domněnce, že vedl život v úplné cudnosti. Voltaire prohlásil, že Newton „neměl vášeň ani slabost“ a že „se nikdy nepřiblížil k žádné ženě“. Jedním z obvinění, která Newton vznesl vůči Johnu Lockeovi v dopisech po svém zhroucení v roce 1693, bylo, že Locke chtěl „vtělit [ho] do žen“. Frank E. Manuel a další tvrdili, že Newton mohl být homosexuál, a spojovali jeho problematický citový život s pocitem viny, který cítil. Vyměnil si přátelské a něžné dopisy s Fatiem de Duillierem a jeho zhroucení následovalo po náhlém konci jejich přátelství v roce 1693. Proto někteří spekulovali, že Newton měl romantické zájmy v mladém matematikovi. Ve své zprávě o hříších Newton uvádí „Mít nečisté myšlenky, slova, činy a sny“, jakož i dvě „recidivy“, jejichž povaha je neznámá. Dále psal o cudnosti mnichů východní církve v jednom ze svých teologických spisů a vysvětloval jejich „boj s inkontinentními myšlenkami“. To Manuel považoval za částečně autobiografické. Avšak kvůli nedostatku důkazů musí být skutečná povaha a rozsah Newtonovy sexuality považovány za neznámé.