Autodiagnostika je náchylná k chybám a může být potenciálně nebezpečná, pokud se na základě chybné diagnózy dělají nevhodná rozhodnutí. Kvůli rizikům od autodiagnostiky oficiálně odrazují vlády, lékaři a organizace pečující o pacienty. Dokonce i lékaři jsou odrazováni od toho, aby se do autodiagnostiky pouštěli, protože lékaři se také při vlastní diagnostice dopouštějí chyb. Pokud je autodiagnostika chybná, pak chybná diagnóza může mít za následek nesprávnou zdravotní péči, včetně nesprávné léčby a nedostatečné péče o závažné stavy.
Za určitých okolností však může být vhodná autodiagnostika. Všechny volně prodejné (volně prodejné) léky jsou nabízeny za předpokladu, že lidé jsou schopni autodiagnostiky, přičemž se nejprve určí, že jejich stav není pravděpodobně vážný, a poté se zjistí možné poškození způsobené nesprávnou medikací menší. U některých stavů je pravděpodobnější, že budou diagnostikovány sami, zejména u jednoduchých stavů, jako jsou známé stavy, jako jsou menstruační křeče, bolesti hlavy.
Komplexní stavy, u nichž jsou medikamenty silně propagovány, včetně stavů jako ADHD u dospělých, představují náročnější situaci. Přímý prodej léků spotřebitelům je široce kritizován za propagaci nevhodné autodiagnostiky. Mezi další stavy, které jsou běžně autodiagnostikovány, patří celiakie.