Některé důkazy usvědčují hipokampus z ukládání a zpracování prostorových informací. Studie na potkanech prokázaly, že neurony v hipokampu mají prostorová palebná pole. Tyto buňky se nazývají place cells. Některé buňky střílejí, když se zvíře ocitne na určitém místě, bez ohledu na směr pohybu, zatímco většina je alespoň částečně citlivá na směr a směr pohybu hlavy. U potkanů mohou některé buňky, označované jako kontextově závislé buňky, měnit svou palebnou dráhu v závislosti na minulosti zvířete (retrospektivně) nebo očekávané budoucnosti (výhledově). Různé buňky střílejí na různých místech, takže pouhým pohledem na palebnou dráhu buněk je možné určit, kde se zvíře nachází. Place cells byly nyní pozorovány u lidí, kteří se podíleli na hledání cesty ve městě virtuální reality. Zjištění vyplynula z výzkumu u jedinců, kterým byly implantovány elektrody do mozku jako diagnostická součást chirurgické léčby závažné epilepsie.
Objev místních buněk vedl k myšlence, že hipokampus by mohl fungovat jako kognitivní mapa – neurální reprezentace uspořádání prostředí. Nedávné důkazy tuto perspektivu zpochybnily, což naznačuje, že hipokampus by mohl být klíčový pro zásadnější procesy v rámci navigace. Bez ohledu na to studie se zvířaty ukázaly, že neporušený hipokampus je nutný pro jednoduché úkoly prostorové paměti (například nalezení cesty zpět ke skrytému cíli).
Bez plně funkčního hipokampu si lidé nemusí úspěšně pamatovat, kde byli a jak se dostat tam, kam míří. Výzkumníci se domnívají, že hipokampus hraje obzvláště důležitou roli při hledání zkratek a nových tras mezi známými místy. Někteří lidé vykazují v tomto druhu navigace větší zručnost než jiní a zobrazení mozku ukazuje, že tito jedinci mají při navigaci aktivnější hipokampy.
Londýnští taxikáři se musí naučit velké množství míst – a znát nejpřímější cesty mezi nimi (musí projít přísným testem The Knowledge, než získají licenci k řízení slavných černých taxíků). Studie na University College London od Maguire et (2000) ukázala, že část hipokampu je u taxikářů větší než u široké veřejnosti a že zkušenější řidiči mají větší hipokampy. Zda větší hipokampus pomůže jedinci stát se taxikářem nebo hledání zkratek pro obživu způsobí, že hipokampus jedince poroste, zatím není objasněno. V této studii však Maguire et al. zkoumal korelaci mezi velikostí šedé hmoty a délkou času, který strávil jako taxikář, a zjistil, že čím déle strávil jedinec jako taxikář, tím větší byl objem pravého hipokampu. Toto zjištění naznačilo autorům, že velikost se s používáním časem zvětšuje.
Studie na krysách na Indianské univerzitě naznačila, že pohlavní dimorfismus v morfologii hipokampu je vázán na pohlavní dimorfismus při opakovaném výkonu v bludišti.[Jak odkazovat a odkaz na shrnutí nebo text] Zdá se, že samci jsou v contexualizaci místa svého pobytu lepší, protože mají více hipokampů, se kterými mohou pracovat.