Morton Prince pocházel z bohaté bostonské rodiny a byl zapojen do společenského a intelektuálního života tohoto města. Chodil na soukromé školy a pak na Harvardovu univerzitu. Lékařský titul získal na Harvardově lékařské fakultě v roce 1879. Po Harvardu absolvoval „Grand Tour“ po Evropě, což byl v té době téměř požadavek pro Američany z vyšších vrstev. V Paříži navštívil Jeana Martina Charcota v Salpêtrière. Charcotovy teorie na něj udělaly velký dojem, ale vrátil se do Bostonu, aby si založil otolaryngologickou praxi. Kouzlo charismatického Charcota však bylo silné a on rychle přepnul svou praxi na neurologii, a dokonce přijal Charcotovo showmanství pro výuku svých tříd.
Stal se oddaným a zaníceným zastáncem používání sugesce při léčbě duševních chorob ve Spojených státech a přitahoval kolem sebe všechny významné odborníky na vzkvétající obor abnormální psychologie té doby: Borise Sidise, Jamese Jacksona Putmana, Williama Jamese, G. Stanleyho Halla, abychom jmenovali jen několik. Stal se americkým odborníkem na disociativní poruchy, které také říkal mnohočetná porucha osobnosti. (Mnoho jeho dnešních pacientů by pravděpodobně bylo diagnostikováno jako hraniční porucha osobnosti). Publikoval četné zprávy o případech, jak v akademickém tisku, tak v populárním tisku. Jeho nejznámějším případem byl případ Sally Beauchampové, podrobně popsaný v knize Disociace osobnosti (1906), který vyvolal určité zděšení, jak kvůli senzační povaze předkládaných případů, tak kvůli spletitému stylu prózy.
Prince udržoval aktivní profesionální život, a to nejen svými psychopatologickými studiemi, ale také jako praktikující lékař. Byl plodným spisovatelem, vydal asi 14 knih a mnoho esejů. Psal převážně o disociaci a abnormální psychologii, ale také aplikoval své chápání nevědomí na politiku své doby. I když se jeho psychologické myšlenky nikdy neujaly, zůstal významnou osobností, založil Harvardskou psychologickou kliniku v roce 1927, jen dva roky před svou smrtí. Tato klinika založila významnou americkou silnou pozici pro rozsáhlé psychologické výzkumy osobnosti, které zahrnovaly řadu významných osobností tohoto oboru (Henry Murray, Gordon Allport a Robert W.
Prince byl jako mnoho prominentních mužů psychologické vědy na přelomu 20. století, kteří se stali obskurními. Byli uchváceni novou vědou o duševním životě, která se pokusila vybojovat psychopatologii ze spárů moralismu, který ji považoval za degeneraci, nebo z medicíny, která viděla dědičnou degeneraci, ale dosud nerozvinula zastřešující teorii. Prince zdůraznil důležitost podvědomí k hysterickým symptomům ve stejné době jako Freud, ale byl kritický k psychoanalýze a raději nastínil svou výstřední pozici, která se nikdy nestala populární. A jeho průlomová práce o osobnosti se stala slavnou přes Henryho Murrayho, který převzal funkci ředitele Kliniky a pracoval na jejím rozpracování do systematičtějšího a přístupnějšího způsobu.