Synaptická farmakologie je ve farmakologii studium léků, které působí na synapse. Zabývá se složením, užitím a účinky léků, které mohou zvyšovat (receptor) nebo snižovat (blokátor) aktivitu na synapsi, což je spojka, přes kterou prochází nervový impuls z axonového terminálu do neuronu, svalové buňky nebo buňky žlázy.
Následuje částečný seznam farmakologických látek, které působí na synapse.