Translační frameshift

Translační frameshifting neboli ribozomální frameshifting označuje alternativní proces proteinového překladu. Obvykle se protein překládá z jednoho konce šablony na druhý, zpravidla z 3′ na 5′ konec (nebo z 5′ na 3′ konec nově přeloženého vlákna). Některé organismy však mohou při překladu genetického kódu vykazovat změnu nebo posun v ribozomálním rámci. To se považuje za translační nebo ribozomální frameshifting.

Proteiny se překládají jednosměrně čtením trinukleotidů na řetězci mRNA, také známých jako kodony. Proto posun libovolného počtu nukleotidů, který není dělitelný 3 ve čtecím rámci, povede k tomu, že následné kodony se budou číst úplně jinak. To efektivně mění ribozomální čtecí rámec. Například následující věta, když se čte od začátku, dává čtenáři smysl:

Nicméně, změna čtecího rámce řekněme posunutí prvního čtení o jedno písmeno nahoru mezi T a H na prvním slově:

Teď ta věta nedává absolutně žádný smysl. V případě překládajícího ribozomu může frameshift vést k tomu, že po frameshiftu vznikne nesmysl nebo že po frameshiftu vznikne úplně jiný protein. Když mluvíme o translačním frameshiftu, je vždy odvozeno to druhé, přičemž to první je obvyklý nešťastný důsledek bodové mutace, jako je například delece.

Hlavní rozdíly mezi frameshiftem v důsledku mutace a frameshiftem v důsledku ribozomálního frameshiftu jsou v tom, že existuje několik mechanismů používaných k ovládání tohoto posledně jmenovaného. Všechny jsou založeny na skutečnosti, že ribozomy nepřevádějí proteiny ustálenou rychlostí bez ohledu na sekvenci. Existují určité kodony, jejichž překlad trvá déle kvůli skutečnosti, že v cytosolu není stejné množství dNTP daného kodonu. Proto existují sekvence známé jako záchytné body (malé úseky hůře nalezených kodonů, což vede ke zpomalenému ribozomovému překladu) a kluzké sekvence (malé úseky velmi snadno přístupných kodonů, což vede k rychlému ribozomovému překladu), které řídí rychlost ribozomálního frameshiftu. Kluzké sekvence mohou potenciálně způsobit, že čtený ribozom „uklouzne“ a přeskočí řadu nukleotidů (obvykle jen 1) a poté přečte zcela jiný snímek. Záchytné body snižují pravděpodobnost, že se tak stane.

Doporučujeme:  Diabetes mellitus

Tento typ frameshingu může být naprogramován tak, aby k němu docházelo na konkrétních rekordovacích místech, a je důležitý u některých virů (např. SARS, HIV) a některých buněčných genů (např. prfB a release factor). Jeho využití je primárně pro zhutňování více genetických informací do kratšího množství genetického materiálu.