V genetickém kódu je stop kodon (nebo terminační kodon) nukleotidová trojice v messengerové RNA, která signalizuje ukončení translace. Proteiny jsou založeny na polypeptidech, což jsou unikátní sekvence aminokyselin. Většina kodonů v messengerové RNA odpovídá přidání aminokyseliny do rostoucího polypeptidového řetězce, který se nakonec může stát proteinem. Stop kodony signalizují ukončení tohoto procesu vazbou uvolňovacích faktorů, které způsobují oddělení ribozomálních podjednotek a uvolnění řetězce aminokyselin.
Ve standardním genetickém kódu je několik stop kodonů:
Kodon UGA byl nedávno identifikován jako kodon kódující Selenocystein (Sec). Tato aminokyselina se nachází v 25 selenoproteinech, kde se nachází v aktivním místě proteinu. Přepis tohoto kodonu je umožněn blízkostí prvku SECIS (SElenoCysteine Incorporation Sequence).
Kodon UAG se může přeložit do pyrrolýzy podobným způsobem, jakým je zakódován selenocystein.
Nesmyslné mutace jsou změny v sekvenci DNA, které zavedou předčasný stop kodon, který způsobí abnormální zkrácení jakékoli výsledné bílkoviny. To často způsobuje ztrátu funkce v bílkovině, protože kritické části řetězce aminokyselin se již nevytvářejí. Kvůli této terminologii jsou stop kodony také označovány jako nesmyslné kodony.
Jantarové, okrové a opálové názvosloví
Stop kodony dostaly historicky mnoho různých jmen, protože každý odpovídal odlišné třídě mutantů, které se všechny chovaly podobným způsobem. Tyto mutanty byly nejprve izolovány v rámci bakteriofágů (T4 a lambda), což jsou viry, které infikují bakterie Escherichia coli. Mutace ve virových genech oslabily jejich infekční schopnost, někdy se vytvořily viry, které byly schopny infikovat a růst pouze v rámci určitých odrůd E coli.