Anatomické systémy nebo orgánový systém jsou systémy anatomicky příbuzných struktur.
Psychologové se o tyto systémy zajímají do té míry, že mění, způsobují, usnadňují, zprostředkovávají a/nebo potlačují myšlenky, pocity, chování a další psychologické jevy.
Orgány v rámci systému mohou být příbuzné v mnoha ohledech, ale vztahy funkce jsou nejčastěji používány. Například močový systém zahrnuje orgány, které společně vyrábějí, ukládají a přenášejí moč.
Funkce orgánových systémů se často významně překrývají. Například nervový a endokrinní systém fungují prostřednictvím sdíleného orgánu, hypothalamu. Z tohoto důvodu jsou oba systémy kombinovány a studovány jako neuroendokrinní systém. Totéž platí pro muskuloskeletální systém, který zahrnuje vztah mezi svalovou a kosterní soustavou.