Patogeneze je mechanismus, kterým určitý etiologický faktor způsobuje onemocnění (patos = nemoc, geneze = vývoj).
Některé formy patogeneze jsou:
U většiny nemocí působí více patogenních procesů. Například určité druhy rakoviny vznikají v důsledku dysfunkce imunitního systému (kožní nádory a lymfomy po transplantaci ledviny – která vyžaduje imunosupresi).
Potenciální etiologie je často identifikována epidemiologickými pozorováními ještě před tím, než může být vytvořena patologická souvislost mezi příčinou a onemocněním.