1 – blastula, 2 – gastrula; oranžová – ektoderm, červená – endoderm.
Fáze gastruly embryonálního vývoje je pozorována u všech zvířat kromě houbiček. Následuje po fázi blastuly. Účelem gastrulace je umístění tří vrstev embryonálních zárodků, endodermu, ektodermu a mezodermu. Během gastrulace embryonální buňky migrují otvorem v embryu známým jako blastokol.
Existuje pět hlavních typů pohybů buněk v gastrulaci – ingrese, involuce, invaginace, delaminace a epibolie. Ingrese je pohyb jednotlivých buněk dovnitř, involuce je inturnace spodní buněčné vrstvy způsobená pohybem horní vrstvy, invaginace je infolding, nebo šťouchání, buněk, delaminace je, když se jeden list buněk rozdělí na dvě, a epibolie je, když je embryo zahrnuto ektodermem. Jakmile je gastrulace dokončena, všechny zárodečné vrstvy jsou na správném místě a začíná další růst a organogeneze.