Schéma hipokampálních oblastí. GŘ: Dentate gyrus.
Hipokampus se skládá z více podpolí. I když se terminologie mezi autory liší, nejčastěji se používají termíny dentate gyrus a cornu ammonis (doslova „Amunovy rohy“, zkráceně CA). dentate gyrus obsahuje fascia dentata a hilus, zatímco CA se rozlišuje na pole CA1, CA2 a CA3.
Hipokampus řezaný v průřezu má tvar písmene C, který připomíná beraní rohy. Název cornu ammonis odkazuje na egyptské božstvo Amun, které má hlavu berana. Rohatý vzhled hippocampu je způsoben rozdíly v hustotě buněk a existencí různého stupně neuronálních vláken.
U hlodavců je hipokampus umístěn tak, že zhruba jeden konec je v blízkosti horní části hlavy (hřbetní nebo septální konec) a jeden konec v blízkosti spodní části hlavy (ventrální nebo temporální konec). Jak je znázorněno na obrázku, samotná struktura je zakřivená a podpole nebo oblasti jsou definovány podél křivky, od CA4 po CA1 (pouze CA3 a CA1 jsou označeny). Oblasti CA jsou také strukturovány do hloubky v jasně definovaných vrstvách (nebo vrstvách):
Zubní gyrus se skládá z podobné řady vrstev:
frontální lalok: předklokální gyrus (primární motorická kůra, 4), předklokální sulcus, nadřazený frontální gyrus (6, 8), střední frontální gyrus (46), nižší frontální gyrus (Brocova plocha, 44 pars opercularis, 45 pars triangularis), prefrontální kůra (orbitofrontální kůra, 9, 10, 11, 12, 47)
parietální lalok: postcentrální sulcus, postcentrální gyrus (1, 2, 3, 43), superior parietální lobule (5), inferior parietální lobule (39-angulární gyrus, 40), precuneus (7), intraparietální sulcus
týlní lalok: primární zraková kůra (17), klínový, lingvální gyrus, 18, 19 (18 a 19 rozpětí celý lalok)
temporální lalok: příčný temporální gyrus (41-42-primární sluchová kůra), nadřazený temporální gyrus (38, 22-Wernickeho oblast), střední temporální gyrus (21), nižší temporální gyrus (20), fusiformní gyrus (36, 37)
limbický lalok/fornicate gyrus: cingulate cortex/cingulate gyrus, anterior cingulate (24, 32, 33), posterior cingulate (23, 31), isthmus (26, 29, 30), parahippocampal gyrus (piriform cortex, 25, 27, 35), entorhinal cortex (28, 34)
subkortikální/insulární kůra: rhinencephalon, čichový bulb, corpus callosum, laterální komory, septum pellucidum, ependyma, vnitřní kapsle, corona radiata, vnější kapsle
tvorba hippocampu: dentate gyrus, hippocampus, subiculum
bazální ganglie: striatum (caudatní jádro, putamen), lentiformní jádro (putamen, globus pallidus), klaustrum, extrémní kapsle, amygdala, nucleus accumbens
Některé kategorizace jsou aproximace a některé Brodmannovy oblasti překlenují gyri.