V medicíně se hypoventilace (také známá jako respirační deprese) vyskytuje, když ventilace není dostatečná (hypo znamená „níže“) k provedení potřebné výměny plynu. Obecně způsobuje zvýšenou koncentraci oxidu uhličitého (hyperkapnie) a respirační acidózu. Může být způsobena zdravotním stavem, zadržením dechu nebo léky, obvykle při předávkování. Hypoventilace může být nebezpečná pro ty, kteří mají spánkovou apnoe.
Jako vedlejší účinek léků nebo rekreačních drog se hypoventilace může stát potenciálně život ohrožující. Mnoho různých léků tlumících činnost CNS, jako jsou alkohol, benzodiazepiny, barbituráty, GHB a opiáty, vyvolává respirační depresi, pokud jsou užívány ve velkých nebo nadměrných dávkách; to je však nejčastěji vnímáno jako příčina smrti u opiátů nebo opioidů, zejména pokud jsou kombinovány se sedativy, jako je alkohol nebo benzodiazepiny. Silné opiáty nebo opioidy, jako je heroin a fentanyl, jsou notoricky známé tím, že tento účinek vyvolávají; při předávkování může jedinec zcela přestat dýchat (dojde k zástavě dýchání), což je bez léčby rychle smrtelné.
Respirační stimulanty, jako je nikethamid, se tradičně používaly k potlačení respirační deprese po předávkování antidepresivy CNS, ale jejich účinnost byla pouze omezená. V současné době se zkoumá nový respirační stimulant BIMU8, který se zdá být výrazně účinnější a může být užitečný pro potlačení respirační deprese vyvolané opiáty a podobnými léky, aniž by se vyrovnaly jejich terapeutické nebo rekreační účinky.
Je rozpoznána porucha označovaná jako „vrozený centrální hypoventilační syndrom“ nebo „CCHS“. Tento stav může být významným faktorem v některých případech syndromu náhlého úmrtí kojenců nebo „úmrtí dětského lůžka“.
Opačným stavem je hyperventilace (příliš mnoho ventilace), jejímž výsledkem je nízká hladina oxidu uhličitého (hypokapnie), spíše než hyperkapnie.