Anglický psychoanalytik John Carl Flügel se narodil v Londýně 13. června 1884.
Flügel otec byl německy a jeho matka anglicky, a rodina měla také úzké vazby s Francií, a tak Flügel naučil všechny tři jazyky, jak vyrůstal.
V roce 1913 se oženil s Ingeborg Klingbergovou, která se také stala psychoanalytičkou. Měli spolu jednu dceru.
Kvůli vrozené malformaci jeho nohou, však, neměl sledovat normální vzor středoškolského vzdělání. Ve věku pouhých 17 let navštěvoval Oxfordskou univerzitu, kde studoval filozofii a rostl zájem o hypnózu, stal se členem Frederick Myers’s Society for Psychical Research. Získal doktorát z filozofie v Oxfordu a doktorát vědy na University of London,
Zůstal na University of London a učil jako pomocný profesor, mezi 1929 a 1944, v experimentální psychologie laboratoře.
Byl čestným členem Britské psychologické společnosti a čestným členem Indické psychologické asociace, v roce 1948 byl předsedou Programového výboru Mezinárodního kongresu o duševním zdraví a v roce 1950 předsedou sekce psychologie Britské lékařské asociace.
Flügel byl čestným tajemníkem Britské psychologické společnosti v letech 1911 až 1920, čestným knihovníkem v letech 1911 až 1932 a jejím předsedou v letech 1932 až 1935. Během první světové války učinil řadu významných příspěvků společnosti.
Po absolvování psychoanalýzy s Ernestem Jonesem se oba stali přáteli a Flügel se v roce 1919 zapojil do refoundingu Britské psychoanalytické společnosti. V letech 1919 až 1924 byl také tajemníkem Mezinárodní psychoanalytické asociace a s Ernestem Jonesem pomohl v roce 1920 vytvořit International Journal of Psychoanalysis. Pomohl také přeložit Vorlesungen Sigmunda Freuda (Úvodní přednášky o psychoanalýze; 1916-1917a [1915-1917]).
V roce 1932 byl zvolen předsedou Britské psychologické společnosti
Flüge zemřel v Londýně dne 17. srpna 1955.