Melatoninový receptor je receptor spřažený s G proteinem (GPCR), který váže melatonin.
Byly naklonovány tři typy melatoninových receptorů. Podtypy receptorů MT1 (nebo Mel1a nebo MTNR1A) a MT2 (nebo Mel1b nebo MTNR1B) jsou přítomny u lidí a dalších savců, zatímco další podtyp melatoninových receptorů Mel1c byl identifikován u obojživelníků a ptáků.
U savců se melatoninové receptory nacházejí v mozku a některých periferních orgánech. Existují však značné rozdíly v hustotě a umístění exprese melatoninových receptorů mezi jednotlivými druhy.
Podtyp MT1 je přítomen v pars tuberalis hypofýzy a suprachiasmatických jádrech hypotalamu. Podtyp MT2 je přítomen především v sítnici. Receptor typu Mel1c mnoha nižších obratlovců je exprimován v mnoha oblastech mozku.