Prostorová epidemiologie je obor zdravotní geografie a epidemiologie zaměřený na studium prostorového rozložení zdravotních výsledků.
Konkrétně se prostorová epidemiologie zabývá popisem a zkoumáním nemoci a jejích geografických variací. Provádí se s ohledem na „demografické, environmentální, behaviorální, socioekonomické, genetické a infekční rizikové faktory“.