Amygdalae jsou dvě malé, kulaté struktury umístěné před hipokampi poblíž časových pólů. Amygdalae se podílejí na rozpoznávání a poznávání těch částí našeho okolí, které jsou důležité a mají citový význam. Jsou kritické pro produkci emocí a mohou být zvláště kritické pro negativní emoce, zejména strach.