Pohlavní orgán nebo primární pohlavní znak, úzce definovaný, je jakákoli z těch částí těla (které nejsou podle přísné definice vždy tělesnými orgány), které se podílejí na pohlavní reprodukci a tvoří reprodukční systém ve složitém organismu; konkrétně:
Obecněji a populárněji se termín „pohlavní orgán“ vztahuje na jakoukoli část těla zapojenou do erotické rozkoše. Větší seznam by jistě zahrnoval řitní otvor pro obě pohlaví, prepuce, prsa (zejména bradavky) pro ženy a bradavky pro muže.
Latinský termín genitálie se používá k popisu pohlavních orgánů a v anglickém jazyce se tento termín a oblast genitálií nejčastěji používá k popisu zevně viditelných pohlavních orgánů nebo zevních genitálií: u mužů penisu a šourku, u žen vulvy. Ostatní části pohlavních orgánů se nazývají vnitřní genitálie.
Gonáda je pohlavní orgán, který u člověka produkuje gamety, konkrétně varlata nebo vaječníky.
Orgány sexuální anatomie pocházejí ze společného anlagu a diferencují se na mužské nebo ženské pohlavní orgány. O směru této diferenciace rozhoduje gen SRY, který se obvykle nachází na chromozomu Y a kóduje rozhodující faktor varlete. Každý pohlavní orgán jednoho pohlaví má homologický protějšek u druhého pohlaví. Viz seznam homologů lidského reprodukčního systému.
Anatomické pojmy vztahující se k pohlaví
Následuje seznam anatomických pojmů vztahujících se k sexu a sexualitě: