Pojem systémové systémy je od 90. let název pro obor vědy, který studuje holistické systémy, který se snaží vyvinout logicko-matematický rámec, v němž lze studovat fyzikální a metafyzikální systémy. Tento pojem se začal spojovat s kybernetikou, teorií systémů, systémovou vědou, socio-kognitivním inženýrstvím a systémovým koučováním.
Zahrnutí obecných principů filozofie systémů a vědeckých paradigmat, charakterizuje systémy. Takovou perspektivu představuje teleologická a holistická metateorie TOGA (1993), kde byla do systémů přidána nová paradigmata vztahující se k inteligentním systémům.