Transkripční faktor

Transkripční faktor je v molekulární biologii bílkovina, která váže DNA v určité promotorové nebo zesilovací oblasti nebo místě, kde reguluje transkripci. Transkripční faktory mohou být selektivně aktivovány nebo deaktivovány jinými bílkovinami, často jako poslední krok v transdukci signálu.

Existují tři třídy transkripčních faktorů:

Motivy nalezené v transkripčních faktorech

Příklady transkripčních faktorů

Signální snímače a aktivátor transkripčního (STAT) proteinu regulují mnoho aspektů buněčného růstu, přežití a diferenciace. Transkripční faktory této rodiny jsou aktivovány Janus Kinase JAK a dysregulace této dráhy je často pozorována u primárních nádorů a vede ke zvýšené angiogenezi a zvýšenému přežití nádorů. Knockoutové studie poskytly důkazy, že STAT proteiny se podílejí na vývoji a funkci imunitního systému a hrají roli při udržování imunitní tolerance a dohledu nad nádory.

STAT proteiny byly původně popsány jako latentní cytoplazmatické transkripční faktory, které vyžadují fosforylaci pro jadernou retenci. Neufosforylované STAT proteiny kloužou mezi cytosolem a jádrem a čekají na jeho aktivační signál. Jakmile se aktivované transkripční faktory dostanou do jádra, vážou se na konsenzuální motiv rozpoznávání DNA zvaný gama aktivovaná místa (GAS) v promotorové oblasti indukovatelných genů cytokinů a aktivují transkripci těchto genů.

Aktivace STAT proteinů

Extracelulární vazba cytokinů indukuje aktivaci intracelulární Janusovy kinázy, která fosforyluje specifický tyrosinový zbytek v STAT proteinu, který podporuje dimerizaci STAT monomerů prostřednictvím jejich SH2 domény. Fosforylovaný dimer je pak aktivně transportován v jádře prostřednictvím komplexu importin a/b a RanGDP. Jakmile se aktivní STAT dimer dostane do jádra, naváže se na cytokiny indukovatelné promotorové oblasti genů obsahujících motiv gama aktivovaného místa (GAS) a aktivuje transkripci těchto proteinů. STAT protein může být dephosforylován jadernými fosfatázami, což vede k inaktivaci STAT a transkripční faktor je transportován z jádra vývozem v crm1/RanGTP.gg

Zápisy transkripčních faktorů v genetických databázích