Doktorát medicíny získal v roce 1823 a později byl profesorem na Hôpital de la Charité v Paříži. Portorikánský vůdce nezávislosti, chirurg a nositel Řádu čestné legie,
Bouillaud prováděl výzkum mnoha zdravotních chorob a stavů, včetně rakoviny, cholery, srdečních chorob a encefalitidy, abychom jmenovali alespoň některé. Je znám pro poskytování korelace mezi revmatismem a srdečními chorobami.
V roce 1825 Bouillaud publikoval knihu Traité clinique et physiologique de l’encéphalite, ou inflammation du cerveau, do které zahrnul jednu z prvních studií o lokalizaci mozkových funkcí. Tvrdil, že ztráta artikulované řeči byla spojena s lézemi předního laloku.