Profesor Stephen Muggleton FBCS, FIET, FAAAI, FREng (narozen 6. prosince 1959) je vedoucím laboratoře výpočetní bioinformatiky na Imperial College London. Obdržel bakalářský titul z informatiky (1982) a doktorát z umělé inteligence (1986), kde byl pod dohledem Donalda Michieho z Edinburské univerzity. Poté pracoval jako postdoktorský výzkum na Turingově institutu v Glasgow (1987–1991) a později jako EPSRC Advanced Research Fellow na Oxford University Computing Laboratory (1992–1997).
V letech 1997-2001 zastával funkci profesora strojového učení na Univerzitě v Yorku a v letech 2001-2006 funkci EPSRC profesora výpočetní bioinformatiky na Imperial College v Londýně. Od roku 2007 je držitelem Královské akademie strojírenského výzkumu a také postu ředitele modelování pro Imperial College Centre for Integrated Systems Biology. Je známý jako zakladatel oblasti Induktivního logického programování. V této oblasti přispěl k teorii zavádějící predikátový vynález, inverzní dědičnost a stochastické logické programy. Hrál také roli ve vývoji systémů, kde se podílel na systémech Duce, Golem a Progol a aplikacích – zejména biologických predikčních úloh.
On a Stephen Emmott v současné době (od roku 2007) pracují na robotickém vědci, který by byl schopen kombinovat induktivní logiku s pravděpodobnostním uvažováním.