V akademickém publikování je vědecký časopis periodická publikace určená k dalšímu rozvoji vědy, obvykle prostřednictvím zpráv o novém výzkumu. Většina časopisů je úzce specializovaná, ačkoli některé z nejstarších časopisů, jako je Nature, publikují články a vědecké práce v širokém spektru vědních oborů. Vědecké časopisy obsahují články, které prošly recenzním řízením, jehož cílem je zajistit, aby články splňovaly standardy kvality a vědecké platnosti daného časopisu. Ačkoli se vědecké časopisy na první pohled podobají časopisům, ve skutečnosti se od sebe značně liší. Vydání vědeckého časopisu se málokdy čtou náhodně, jako se čtou časopisy. Články jsou psány v rámci vědecké metody; zpravidla musí obsahovat dostatek podrobností o experimentu, aby nezávislý výzkumník mohl experiment případně zopakovat a ověřit jeho výsledky. Takové články v časopisech jsou považovány za součást trvalého vědeckého záznamu.
Standardy, které časopis používá k určení publikace, se mohou značně lišit. Některé časopisy, například Nature, Science, PNAS nebo Physical Review Letters, článek nezveřejní, pokud se nedomnívají, že představuje zásadní průlom v daném oboru, a proto odmítají články obsahující dobrou práci, která toto kritérium nesplňuje. V mnoha oborech existuje neformální hierarchie vědeckých časopisů; nejprestižnější časopis v daném oboru bývá nejvybíravější, pokud jde o články, které vybere k publikaci. Je také běžné, že časopisy mají regionální zaměření a specializují se na publikování článků z určitého zeměpisného regionu.
Články jsou zpravidla vysoce odborné a představují nejnovější teoretický výzkum a experimentální výsledky v oblasti vědy, kterou se časopis zabývá. Často jsou nesrozumitelné pro kohokoli jiného než pro výzkumné pracovníky v daném oboru. Vědecké časopisy jsou důležitou součástí vědecké literatury.
Existuje několik typů časopiseckých článků; přesná terminologie a definice se liší podle oboru a konkrétního časopisu, ale často zahrnují:
Formáty článků v časopisech se liší, ale téměř vždy se řídí následujícím obecným schématem. Začínají abstraktem, což je shrnutí článku o jednom až čtyřech odstavcích. V úvodu je popsáno pozadí výzkumu včetně diskuse o podobných výzkumech. Část věnovaná materiálům a metodám nebo experimentům uvádí konkrétní podrobnosti o tom, jak byl výzkum proveden. Oddíl výsledky a diskuse popisuje výsledky a důsledky výzkumu a oddíl závěr uvádí výzkum do souvislostí a popisuje možnosti dalšího zkoumání.
Některé vědecké časopisy, jako například Science, obsahují kromě výše uvedeného také sekci zpráv, kde je popsán vědecký vývoj (často zahrnující politické otázky). Tyto články často nepíší vědci, ale vědečtí novináři. Kromě toho některé časopisy obsahují redakční sekci a sekci pro dopisy redakci. I když se jedná o články publikované v rámci časopisu, nejsou obecně považovány za vědecké články, protože nebyly recenzovány.
Tvrdí se, že recenzované papírové časopisy jsou v procesu nahrazování elektronickým publikováním.
Než je článek zveřejněn v časopise, uplyne obvykle několik měsíců od jeho napsání, a proto časopisy nejsou ideálním formátem pro šíření nejnovějšího výzkumu. V některých oborech, jako je astronomie, byla úloha časopisu při šíření nejnovějšího výzkumu do značné míry nahrazena databázemi preprintů, jako je arXiv.org. Vědecké časopisy však stále hrají důležitou roli při kontrole kvality, archivaci článků a vytváření vědeckého kreditu. Obecně platí, že elektronické materiály nahrané do databází preprintů jsou stále určeny k případnému zveřejnění v recenzovaném časopise.
Dalším sporným bodem jsou náklady na vědecké časopisy. Mnoho vědců a knihovníků protestuje proti nákladům na časopisy, zejména proto, že tyto poplatky jdou do rukou velkých ziskových vydavatelství. Také skutečnost, že autorská práva jsou přidělena vydavateli časopisu, a nikoli autorům, vyvolává mnoho diskusí.
Existuje článek s názvem „Online nebo neviditelný?“. (viz níže), který pomocí statistických argumentů tvrdí, že elektronické publikování umožňuje širší šíření. Řada časopisů při zachování recenzního řízení zavedla elektronické verze nebo dokonce zcela přešla na elektronické publikování.